La Junta Directiva está formada por un Directora y un Subdirector. Sus funciones consisten en organizar el funcionamiento del Centro y programar el calendario anual de actividades del mismo.
Actualmente la directora del Centro es María Salvador Martínez, Profesora Titular de Derecho Constitucional, del Departamento de Derecho Político de la UNED y el subdirector del Centro es Jorge Alguacil González-Aurioles, Profesor Titular de Derecho Constitucional, del Departamento de Derecho Político de la UNED.
